Canlı hücrelerin yapay zeka modellerine 30 milyon dolar yatırım

Biyolojinin en büyük hedeflerinden biri canlı bir hücrenin dijital simülasyonunu yapmak. Araştırmacılar yeni ilaçların vücutta nasıl tepki vereceğini bilgisayarlar yardımıyla daha doğru anlayabilirlerse, hayvanlar ve insanlarda test edildiğinde daha fazla güven duyabilirler. Ancak büyük dil modelleri proteinlerin nasıl davrandığını modellemede önemli ilerlemeler sağlasa da aynı teknolojiyi tüm bir hücrenin karmaşıklıklarını simüle etmek için uygulamak henüz beklenen sonucu vermedi. Basitçe yeterli veri yok.

Ancak bu yılın şubat ayında, Tahoe Therapeutics adlı bir girişim, Tahoe-100M adlı 100 milyon farklı veri noktasından oluşan bir koleksiyon yayınlayarak bu hedefe bir adım daha yaklaştı. Bu veriler, farklı kanser hücrelerinin 1.000’den fazla molekülle etkileşimlerine nasıl tepki verdiğini gösteriyor. Perturbasyon (moleküllerin etkisi) olarak adlandırılan bu tür veriler, yapay zeka modellerinin eğitilmesi için kritik çünkü hücrelerin farklı moleküllere nasıl tepki verdiği bilgisi, algoritmanın diğer moleküllerin etkisini tahmin etme yeteneğini artırıyor.

Devasa veri setleri üretiyorlar

Tahoe CEO’su 39 yaşındaki Nima Alidoust Forbes’a yaptığı açıklamada, “Tahoe-100M’in tek hücre veri setleri için Mars’a iniş anı olduğunu düşünüyoruz” dedi. Şirket, bu veri setini kuruluşundan üç yıl geçmeden geliştirebildi çünkü Mosaic platformu, şirketin “farklı organlardan ve birçok farklı hasta türünden hücreleri alıp bir araya getirmesini” sağlıyor. Şirketin CSO’su ve kurucu ortağı Johnny Yu, “Her deney yaptığımızda, hangi ilacın hangi hastayı etkilediğine dair devasa tek hücre atlasları oluşturuyoruz” dedi. 

Alidoust da temel süper güçlerinin sanal hücre modelleri için gereken devasa veri setlerini üretebilme kabiliyetleri olduğunu ekledi.  Bu veri üretimini hızlı şekilde ölçeklendirebilme yeteneği, yapay zeka ile ilaç keşfi üzerine çalışan diğer şirketlere kıyasla Tahoe’nun ayırt edici özelliği. Ayrıca, şirketin sanal hücre modelleri inşa edip bunları kanser ve diğer hastalıklar için yeni tedaviler bulmakta kullanma hedefinin temelini oluşturuyor.

Değeri 120 milyon dolara yükseldi

Tahoe, Amplify Partners liderliğinde 30 milyon dolarlık yeni risk sermayesi yatırımı aldığını duyurdu. Diğer yatırımcılar arasında Databricks Ventures, Wing Venture Capital, General Catalyst, AIX Ventures, Mubadala Ventures, Civilization Ventures ve Conviction yer alıyor. Bu yatırım, şirketin toplam fonlamasını 42 milyon dolara ve değerlemesini 120 milyon dolara çıkardı.

Tahoe’nun yönetim kurulunda da bulunan AIX Ventures ortağı Krish Ramadurai, “Biyoteknolojide kötü yapay zeka tahminleri sürekli bir hayal kırıklığı kaynağı old. Bu yapay zeka algoritmaları sürekli bir şeyler öneriyor, sonra laboratuvarda test ettiğinizde hepsi berbat çıkıyor” dedi. Tahoe’nun üretebildiği veriler ise yeni modellerin doğruluğu için kritik fark yaratıyor.

Tahoe’nun 100 milyonluk veri setini yayınlamasından sadece birkaç ay sonra, kar amacı gütmeyen araştırma kuruluşu Arc Institute, Tahoe-100M’yi eğitim verisi olarak kullanan açık kaynaklı sanal hücre modeli State’i yayınladı. Benchmark testlerinde Arc, diğer YZ modellerinin iki katı doğruluk gösterdi ve önceki temel modelleri yenen daha basit makine öğrenimi programlarını da geride bıraktı.

Bu Tahoe kurucu ortağı 34 yaşındaki Yu için neredeyse on yıllık bir çalışmanın kanıtı. Mosaic’in temel teknolojisini, Kaliforniya Üniversitesi San Francisco’da biyokimya ve biyofizik profesörü Hani Goodarzi’nin laboratuvarında geliştirdi. Alidoust, Goodarzi ile Princeton’da sınıf arkadaşıyken tanışmıştı. İkili 2022’de sanal hücre modelleri oluşturmak için şirket kurma fikrini konuşmak üzere yeniden bir araya geldi. Goodarzi, böyle bir şirket için önemli bir unsurun büyük ölçekli veri toplama olacağını söyledi ve Yu’yu ekibe kattı.

Bir ay sonra, üçü birlikte Tahoe’yu (o zamanki adıyla Vevo Therapeutics) UCSF araştırmacısı 60 yaşındaki Kevin Shokat ile birlikte kurdu. Şirket, Aralık 2022’de 12 milyon dolarlık tohum yatırımı aldı. Hukuki bir itiraz sonrası isim bu yıl Nisan ayında Vevo’dan Tahoe’ya değiştirildi.

Yeni ilaç geliştirmeye odaklanacaklar

Yeni sermayeyle Tahoe şimdi kendi sanal hücre modellerini destekleyecek bir milyardan fazla tek hücre veri noktası içeren veri seti oluşturmaya odaklanıyor. Kendi modelleri ve özel verileri ile kanserle mücadelede yeni ilaç geliştirme hızlanıyor. Alidoust, Tahoe’nun şu anda önemli bir kanser alt tipi için bir ilaç adayına sahip olduğunu ve FDA’nın insanlarda test başlatması için gerekli çalışmaları yürüttüğünü söyledi.

Ayrıca Alidoust, şirketin büyük veri setlerini özel tutmayı planladığını ancak büyük bir ilaç firması veya yapay zeka şirketiyle veri paylaşmayı hedeflediğini belirtti. Amaç, yeni ilaçlar veya yeni ilaç keşfi YZ modelleri geliştirmek için iş birliği yaparak Tahoe’ya daha fazla fırsat yaratmak.